Penguins of Madagascar filminde, ünlü Madagascar penguenleri Skipper, Kowalski, Rico ve Private, gizli bir örgüt olan Kuzey Rüzgarı'na katılırlar. Örgütün lideri, gizli bir ajanın da liderliğini yapmaktadır. İki takımın güçlerini birleştirip dünyayı yok etmek isteyen Dr. Octavius Brine'ı durdurmak için harekete geçerler. Komik ve heyecan dolu maceralarıyla dolu bu animasyon filmde, penguenlerin dünyayı kurtarmak için verdiği mücadele anlatılıyor. Aksiyon dolu sahneler ve eğlenceli karakterlerle dolu bu film, hem çocukların hem de yetişkinlerin keyifle izleyebileceği bir animasyon başyapıtı.